Các trang bị an toàn trên Mazda 3 được trang bị hệ thống cân bằng điện tử DSC, hệ thống chống bó cứng phanh ABS, hệ thống phân phối lực phanh điện tử EBD, hệ thống cảnh báo phanh khẩn cấp ESS, hệ thống hỗ trợ phanh khẩn cấp BA, hệ thống hỗ trợ khởi hành ngang dốc HAC, hệ thống chống trượt TSC, camera lùi, 6 túi khí...
Mazda 3 mới được chứng nhận là một trong những xe Sedan an toàn nhất (Top Safety Pick 2014) từ viện bảo hiểm an toàn đường cao tốc Mỹ (IIHS) cũng như nhận được đánh giá an toàn 5 sao từ tổ chức Euro Ncap.